Istighotsah biasanya dipimpin oleh mursyid tarekat atau yang ditunjuk atau oleh ulama/kyai. Lafadz/dzikir yang dibaca sbb:
Istighfar (astagfirullahal adzim) meminta ampun kepada Allah
Hauqolah (la haula wala quwwata illa billahil aliyyil adzim) meminta kekuatan kepada Allah
Sholawat atau doa untuk Nabi Muhammad SAW dan keluarganya
Lafadz tahlil panjang yang berbunyi “La ilaha illa anta subhanaka inni kuntu minadzolimin” sebagai pengakuan bahwa tiada Tuhan selain Allah dan bahwa hamba yang sedang berdoa telah melakukan perbuatan dzolim.
Memuji asma Allah dengan lafadz “Ya Allah ya Qodim, ya Sami’u ya Basyir, ya Mubdi’u ya Kholiq, ya Hafidz ya Nasir ya Wakilu ya Allah, ya Lathif”
Kemudian bacaan istighotsah “Ya Hayyu ya Qoyyum birohmatika astaghits”
